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BS測序

Bisulfite(全基因組甲基化測序):利用Bisulfite(亞硫酸鹽)對基因組進行處理后上機測序。應用領域:測序可精確到單個堿基的甲基化,能得到全基因組的甲基化位點信息,可用于全基因組DNA甲基化圖譜制作;疾病關聯分析;基因調控分析;疾病的甲基化標志物等。

應用領域

全基因組DNA甲基化圖譜構建
基因調控分析

技術路線

分析內容

1. 標準信息分析
  a)   對測序數據進行base calling、raw data 數據整理及數據質量評估;
  b)   去接頭污染,去低質量reads和產量情況統計
  c)   Bisulfite 測序序列與參考基因組序列的比對
  d)   深度和覆蓋度分析
  e)   C 堿基的甲基化水平
  f)   全基因組甲基化水平分布趨勢

 g)  全基因組DNA甲基化圖譜

  h)  差異性甲基化區域(DMR)分析

 2. 高級信息分析
根據具體研究進行的細節分析

樣品要求

樣品類型:DNA 樣品;
樣品需求量:總量≥5μg,濃度≥50ng/μL;
樣品完整性:DNA 無明顯降解,需提供凝膠電泳檢測膠圖。

項目周期

單個樣品標準流程(上圖)的運轉周期約為60個工作日,遇樣品數較多時,項目周期根據項目規模而定。

參考文獻

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